Contexto

Este gráfico se creó como quality check y como inventario de muestras: para enseñar al equipo clínico qué pares de muestras teníamos y cuán separados estaban en el tiempo. No se realizaron pruebas de hipótesis ni se reportaron p-valores; la intención era ver el dataset, detectar casos extremos y decidir qué pares requerían revisión.

Qué pregunta responde

¿Cuánto tiempo separa la toma de tejido y plasma en cada paciente y cómo se distribuye ese intervalo en Concordant y Discordant?

Qué muestra:

• boxplot por grupo con puntos “jittered” encima (beeswarm) que resume la distribución del tiempo entre muestras (mediana e IQR).

• Puntos individuales (cada punto = un paciente) para ver dispersión, densidad y outliers.

• Un eje temporal centrado en 0 meses para interpretar rápidamente “muestras recolectadas al mismo tiempo” vs “separadas en el tiempo”.

Qué destaca

• Los puntos en rojo señalan los casos de subgrupo de interés para los investigadores.

• Las líneas discontinuas marcan umbrales de revisión: pares de muestras potencialmente “demasiado separados” como para interpretar el objetivo de la investigación (concordancia/discordancia) sin contexto clínico.

• La anotación de medianas por grupo ayuda a fijar el “centro” sin hacer cálculos mentales.

Por qué lo diseñé así

• Elegí boxplot + puntos para combinar resumen robusto y transparencia caso a caso (útil en un QC).

• Puse el cero como referencia porque el mensaje principal es la distancia temporal respecto a la toma “ideal” (cercana en el tiempo). Los umbrales discontinuos funcionan como guía de quality check, ayudan a identificar casos a revisar.

Cómo leerlo en 10 segundos

• Mira la mediana (línea central del boxplot) en cada grupo: te dice el intervalo típico.

• Fíjate en la dispersión y los puntos extremos: variabilidad y posibles outliers.

• Busca puntos rojos y su posición respecto a los umbrales: si el subgrupo tiende a intervalos distintos o si concentra casos “a revisar”.

Cosas a mejorar

Este gráfico lo hice en el año 2021. Ahora que lo vuelvo a ver después de tanto tiempo, haría estos cambios:

• Aumentar el espacio entre boxplots para dejar claro a qué grupo pertenece cada punto.
• Diseñar un icono para cada tipo de muestra (muestra de tejido y muestra de sangre) para facilitar la lectura de un vistazo.
• Aumentar la opacidad del gris para generar más contraste con el fondo blanco.
• Indicar el tamaño de muestra (N=…) en cada grupo.
• Mejorar la leyenda: explico qué es el color rojo, pero no qué es el color gris.
• Hacer que el “umbral QC ±2 meses” se lea en 1 segundo con un área ligeramente sombreada.
• El texto “Maximum time between samples = 2 months” podría ir como nota al pie, para evitar esa caja punteada grande abajo (que compite con los datos). Es decir, crear una jerarquía tipográfica.

Herramientas

R (paquete ggplot2) + Inkscape